Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ3

TRIM43, Tripartite motif-containing protein 43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43Q96BQ3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRIM43Q96BQ3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM43Q96BQ3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM43Q96BQ3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM43Q96BQ3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIM43Q96BQ3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM43Q96BQ3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM43Q96BQ3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM43Q96BQ3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM43Q96BQ3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM43Q96BQ3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM43Q96BQ3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM43Q96BQ3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM43Q96BQ3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM43Q96BQ3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM43Q96BQ3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM43Q96BQ3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM43Q96BQ3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM43Q96BQ3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM43Q96BQ3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM43Q96BQ3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM43Q96BQ3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM43Q96BQ3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM43Q96BQ3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM43Q96BQ3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM43Q96BQ3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM43Q96BQ3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM43Q96BQ3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM43Q96BQ3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM43Q96BQ3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM43Q96BQ3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM43Q96BQ3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM43Q96BQ3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM43Q96BQ3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM43Q96BQ3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM43Q96BQ3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM43Q96BQ3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM43Q96BQ3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM43Q96BQ3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM43Q96BQ3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM43Q96BQ3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM43Q96BQ3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM43Q96BQ3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM43Q96BQ3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM43Q96BQ3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM43Q96BQ3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM43Q96BQ3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM43Q96BQ3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM43Q96BQ3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM43Q96BQ3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM43Q96BQ3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM43Q96BQ3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM43Q96BQ3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM43Q96BQ3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM43Q96BQ3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM43Q96BQ3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM43Q96BQ3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM43Q96BQ3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM43Q96BQ3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM43Q96BQ3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM43Q96BQ3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM43Q96BQ3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM43Q96BQ3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM43Q96BQ3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM43Q96BQ3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM43Q96BQ3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM43Q96BQ3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM43Q96BQ3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM43Q96BQ3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM43Q96BQ3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM43Q96BQ3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM43Q96BQ3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM43Q96BQ3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM43Q96BQ3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM43Q96BQ3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM43Q96BQ3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM43Q96BQ3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM43Q96BQ3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM43Q96BQ3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM43Q96BQ3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM43Q96BQ3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM43Q96BQ3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM43Q96BQ3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM43Q96BQ3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM43Q96BQ3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM43Q96BQ3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM43Q96BQ3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM43Q96BQ3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM43Q96BQ3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM43Q96BQ3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM43Q96BQ3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM43Q96BQ3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM43Q96BQ3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM43Q96BQ3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM43Q96BQ3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM43Q96BQ3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM43Q96BQ3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM43Q96BQ3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM43Q96BQ3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms