Protein–RNA interactions for Protein: Q96BI1

SLC22A18, Solute carrier family 22 member 18, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A18Q96BI1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A18Q96BI1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A18Q96BI1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A18Q96BI1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A18Q96BI1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC22A18Q96BI1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC22A18Q96BI1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC22A18Q96BI1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC22A18Q96BI1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC22A18Q96BI1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC22A18Q96BI1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC22A18Q96BI1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC22A18Q96BI1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC22A18Q96BI1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC22A18Q96BI1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC22A18Q96BI1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC22A18Q96BI1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A18Q96BI1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A18Q96BI1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A18Q96BI1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A18Q96BI1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A18Q96BI1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A18Q96BI1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A18Q96BI1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC22A18Q96BI1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC22A18Q96BI1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC22A18Q96BI1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC22A18Q96BI1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC22A18Q96BI1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC22A18Q96BI1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms