Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE4

FUBP1, Far upstream element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP1Q96AE4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FUBP1Q96AE4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FUBP1Q96AE4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FUBP1Q96AE4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FUBP1Q96AE4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FUBP1Q96AE4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FUBP1Q96AE4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FUBP1Q96AE4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FUBP1Q96AE4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FUBP1Q96AE4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FUBP1Q96AE4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FUBP1Q96AE4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FUBP1Q96AE4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FUBP1Q96AE4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FUBP1Q96AE4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FUBP1Q96AE4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FUBP1Q96AE4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FUBP1Q96AE4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FUBP1Q96AE4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FUBP1Q96AE4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FUBP1Q96AE4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FUBP1Q96AE4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FUBP1Q96AE4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FUBP1Q96AE4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FUBP1Q96AE4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FUBP1Q96AE4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FUBP1Q96AE4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FUBP1Q96AE4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FUBP1Q96AE4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FUBP1Q96AE4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FUBP1Q96AE4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FUBP1Q96AE4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FUBP1Q96AE4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FUBP1Q96AE4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FUBP1Q96AE4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FUBP1Q96AE4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FUBP1Q96AE4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FUBP1Q96AE4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FUBP1Q96AE4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FUBP1Q96AE4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FUBP1Q96AE4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FUBP1Q96AE4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FUBP1Q96AE4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FUBP1Q96AE4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FUBP1Q96AE4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FUBP1Q96AE4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FUBP1Q96AE4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms