Protein–RNA interactions for Protein: Q96A49

SYAP1, Synapse-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYAP1Q96A49 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SYAP1Q96A49 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYAP1Q96A49 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYAP1Q96A49 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYAP1Q96A49 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYAP1Q96A49 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYAP1Q96A49 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SYAP1Q96A49 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYAP1Q96A49 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYAP1Q96A49 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYAP1Q96A49 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYAP1Q96A49 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SYAP1Q96A49 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYAP1Q96A49 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SYAP1Q96A49 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYAP1Q96A49 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYAP1Q96A49 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYAP1Q96A49 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYAP1Q96A49 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYAP1Q96A49 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYAP1Q96A49 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYAP1Q96A49 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SYAP1Q96A49 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYAP1Q96A49 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYAP1Q96A49 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYAP1Q96A49 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYAP1Q96A49 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYAP1Q96A49 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SYAP1Q96A49 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYAP1Q96A49 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYAP1Q96A49 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYAP1Q96A49 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYAP1Q96A49 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYAP1Q96A49 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SYAP1Q96A49 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYAP1Q96A49 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SYAP1Q96A49 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYAP1Q96A49 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYAP1Q96A49 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYAP1Q96A49 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYAP1Q96A49 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SYAP1Q96A49 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SYAP1Q96A49 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms