Protein–RNA interactions for Protein: Q969S8

HDAC10, Histone deacetylase 10, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10Q969S8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC10Q969S8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDAC10Q969S8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC10Q969S8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC10Q969S8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms