Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAVIN3Q969G5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CAVIN3Q969G5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAVIN3Q969G5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms