Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HPS3Q969F9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
HPS3Q969F9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HPS3Q969F9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms