Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BHMTQ93088 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BHMTQ93088 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BHMTQ93088 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms