Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
USP7Q93009 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP7Q93009 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP7Q93009 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP7Q93009 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP7Q93009 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP7Q93009 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP7Q93009 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP7Q93009 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP7Q93009 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP7Q93009 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP7Q93009 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP7Q93009 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP7Q93009 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP7Q93009 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP7Q93009 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP7Q93009 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP7Q93009 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP7Q93009 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP7Q93009 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP7Q93009 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP7Q93009 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP7Q93009 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP7Q93009 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP7Q93009 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP7Q93009 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP7Q93009 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP7Q93009 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP7Q93009 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP7Q93009 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP7Q93009 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP7Q93009 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP7Q93009 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP7Q93009 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP7Q93009 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP7Q93009 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP7Q93009 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP7Q93009 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP7Q93009 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP7Q93009 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP7Q93009 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP7Q93009 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP7Q93009 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP7Q93009 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP7Q93009 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP7Q93009 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP7Q93009 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP7Q93009 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP7Q93009 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP7Q93009 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP7Q93009 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP7Q93009 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP7Q93009 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP7Q93009 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP7Q93009 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP7Q93009 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP7Q93009 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP7Q93009 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
USP7Q93009 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP7Q93009 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP7Q93009 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP7Q93009 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP7Q93009 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP7Q93009 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP7Q93009 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP7Q93009 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP7Q93009 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP7Q93009 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP7Q93009 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP7Q93009 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP7Q93009 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP7Q93009 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP7Q93009 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP7Q93009 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USP7Q93009 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP7Q93009 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP7Q93009 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
USP7Q93009 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP7Q93009 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP7Q93009 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP7Q93009 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP7Q93009 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP7Q93009 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP7Q93009 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP7Q93009 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP7Q93009 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP7Q93009 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP7Q93009 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP7Q93009 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP7Q93009 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP7Q93009 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP7Q93009 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP7Q93009 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP7Q93009 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23■■□□□ 1.27
USP7Q93009 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP7Q93009 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
USP7Q93009 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP7Q93009 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP7Q93009 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP7Q93009 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms