Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PTPRUQ92729 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PTPRUQ92729 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPRUQ92729 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPRUQ92729 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPRUQ92729 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PTPRUQ92729 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRUQ92729 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRUQ92729 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRUQ92729 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRUQ92729 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRUQ92729 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTPRUQ92729 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PTPRUQ92729 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PTPRUQ92729 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PTPRUQ92729 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PTPRUQ92729 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
PTPRUQ92729 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PTPRUQ92729 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PTPRUQ92729 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PTPRUQ92729 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PTPRUQ92729 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PTPRUQ92729 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
PTPRUQ92729 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PTPRUQ92729 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PTPRUQ92729 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PTPRUQ92729 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PTPRUQ92729 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PTPRUQ92729 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PTPRUQ92729 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PTPRUQ92729 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PTPRUQ92729 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PTPRUQ92729 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PTPRUQ92729 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PTPRUQ92729 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PTPRUQ92729 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PTPRUQ92729 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTPRUQ92729 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
PTPRUQ92729 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PTPRUQ92729 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRUQ92729 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRUQ92729 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRUQ92729 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRUQ92729 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRUQ92729 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRUQ92729 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PTPRUQ92729 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRUQ92729 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTPRUQ92729 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PTPRUQ92729 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PTPRUQ92729 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PTPRUQ92729 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PTPRUQ92729 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PTPRUQ92729 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PTPRUQ92729 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPRUQ92729 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPRUQ92729 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPRUQ92729 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPRUQ92729 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPRUQ92729 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPRUQ92729 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PTPRUQ92729 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTPRUQ92729 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTPRUQ92729 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTPRUQ92729 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTPRUQ92729 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTPRUQ92729 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTPRUQ92729 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTPRUQ92729 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTPRUQ92729 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PTPRUQ92729 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PTPRUQ92729 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
PTPRUQ92729 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PTPRUQ92729 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPRUQ92729 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPRUQ92729 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPRUQ92729 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPRUQ92729 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPRUQ92729 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPRUQ92729 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPRUQ92729 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PTPRUQ92729 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PTPRUQ92729 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PTPRUQ92729 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PTPRUQ92729 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PTPRUQ92729 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PTPRUQ92729 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRUQ92729 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
PTPRUQ92729 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRUQ92729 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRUQ92729 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRUQ92729 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRUQ92729 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRUQ92729 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PTPRUQ92729 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTPRUQ92729 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTPRUQ92729 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTPRUQ92729 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTPRUQ92729 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTPRUQ92729 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms