Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM3CQ92520 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM3CQ92520 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM3CQ92520 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM3CQ92520 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM3CQ92520 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM3CQ92520 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM3CQ92520 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM3CQ92520 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM3CQ92520 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM3CQ92520 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM3CQ92520 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM3CQ92520 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms