Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPDL3AQ92484 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMPDL3AQ92484 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPDL3AQ92484 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPDL3AQ92484 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPDL3AQ92484 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPDL3AQ92484 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPDL3AQ92484 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPDL3AQ92484 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPDL3AQ92484 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPDL3AQ92484 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPDL3AQ92484 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPDL3AQ92484 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPDL3AQ92484 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPDL3AQ92484 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPDL3AQ92484 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPDL3AQ92484 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPDL3AQ92484 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPDL3AQ92484 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPDL3AQ92484 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPDL3AQ92484 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMPDL3AQ92484 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPDL3AQ92484 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPDL3AQ92484 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPDL3AQ92484 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPDL3AQ92484 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPDL3AQ92484 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPDL3AQ92484 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPDL3AQ92484 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPDL3AQ92484 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPDL3AQ92484 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMPDL3AQ92484 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPDL3AQ92484 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPDL3AQ92484 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPDL3AQ92484 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPDL3AQ92484 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPDL3AQ92484 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPDL3AQ92484 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPDL3AQ92484 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMPDL3AQ92484 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMPDL3AQ92484 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMPDL3AQ92484 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMPDL3AQ92484 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms