Protein–RNA interactions for Protein: Q92466

DDB2, DNA damage-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB2Q92466 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
DDB2Q92466 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DDB2Q92466 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms