Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RUFY2Q8WXA3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RUFY2Q8WXA3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RUFY2Q8WXA3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms