Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWL2

SPIRE2, Protein spire homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE2Q8WWL2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPIRE2Q8WWL2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SPIRE2Q8WWL2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPIRE2Q8WWL2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPIRE2Q8WWL2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPIRE2Q8WWL2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPIRE2Q8WWL2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPIRE2Q8WWL2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPIRE2Q8WWL2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPIRE2Q8WWL2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPIRE2Q8WWL2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPIRE2Q8WWL2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPIRE2Q8WWL2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPIRE2Q8WWL2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPIRE2Q8WWL2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPIRE2Q8WWL2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPIRE2Q8WWL2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SPIRE2Q8WWL2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPIRE2Q8WWL2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPIRE2Q8WWL2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPIRE2Q8WWL2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms