Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVF5

KCTD4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD4Q8WVF5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KCTD4Q8WVF5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCTD4Q8WVF5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCTD4Q8WVF5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCTD4Q8WVF5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCTD4Q8WVF5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCTD4Q8WVF5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCTD4Q8WVF5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCTD4Q8WVF5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCTD4Q8WVF5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCTD4Q8WVF5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCTD4Q8WVF5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCTD4Q8WVF5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCTD4Q8WVF5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
KCTD4Q8WVF5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCTD4Q8WVF5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms