Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DCAF4Q8WV16 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DCAF4Q8WV16 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DCAF4Q8WV16 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DCAF4Q8WV16 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DCAF4Q8WV16 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
DCAF4Q8WV16 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DCAF4Q8WV16 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DCAF4Q8WV16 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DCAF4Q8WV16 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DCAF4Q8WV16 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DCAF4Q8WV16 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DCAF4Q8WV16 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DCAF4Q8WV16 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DCAF4Q8WV16 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DCAF4Q8WV16 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DCAF4Q8WV16 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DCAF4Q8WV16 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DCAF4Q8WV16 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DCAF4Q8WV16 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DCAF4Q8WV16 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DCAF4Q8WV16 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DCAF4Q8WV16 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DCAF4Q8WV16 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DCAF4Q8WV16 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
DCAF4Q8WV16 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DCAF4Q8WV16 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DCAF4Q8WV16 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
DCAF4Q8WV16 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DCAF4Q8WV16 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DCAF4Q8WV16 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DCAF4Q8WV16 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DCAF4Q8WV16 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DCAF4Q8WV16 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
DCAF4Q8WV16 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DCAF4Q8WV16 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
DCAF4Q8WV16 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DCAF4Q8WV16 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DCAF4Q8WV16 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DCAF4Q8WV16 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DCAF4Q8WV16 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DCAF4Q8WV16 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DCAF4Q8WV16 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DCAF4Q8WV16 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DCAF4Q8WV16 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DCAF4Q8WV16 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DCAF4Q8WV16 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DCAF4Q8WV16 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DCAF4Q8WV16 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DCAF4Q8WV16 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DCAF4Q8WV16 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
DCAF4Q8WV16 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DCAF4Q8WV16 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DCAF4Q8WV16 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DCAF4Q8WV16 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DCAF4Q8WV16 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DCAF4Q8WV16 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
DCAF4Q8WV16 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DCAF4Q8WV16 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DCAF4Q8WV16 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DCAF4Q8WV16 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DCAF4Q8WV16 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DCAF4Q8WV16 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
DCAF4Q8WV16 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
DCAF4Q8WV16 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
DCAF4Q8WV16 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DCAF4Q8WV16 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DCAF4Q8WV16 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DCAF4Q8WV16 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DCAF4Q8WV16 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DCAF4Q8WV16 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DCAF4Q8WV16 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DCAF4Q8WV16 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
DCAF4Q8WV16 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DCAF4Q8WV16 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
DCAF4Q8WV16 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DCAF4Q8WV16 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DCAF4Q8WV16 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
DCAF4Q8WV16 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DCAF4Q8WV16 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DCAF4Q8WV16 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DCAF4Q8WV16 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DCAF4Q8WV16 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DCAF4Q8WV16 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
DCAF4Q8WV16 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DCAF4Q8WV16 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DCAF4Q8WV16 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DCAF4Q8WV16 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DCAF4Q8WV16 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DCAF4Q8WV16 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DCAF4Q8WV16 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DCAF4Q8WV16 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DCAF4Q8WV16 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DCAF4Q8WV16 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DCAF4Q8WV16 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DCAF4Q8WV16 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DCAF4Q8WV16 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DCAF4Q8WV16 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DCAF4Q8WV16 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DCAF4Q8WV16 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms