Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ7

GNPDA2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA2Q8TDQ7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GNPDA2Q8TDQ7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GNPDA2Q8TDQ7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GNPDA2Q8TDQ7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GNPDA2Q8TDQ7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GNPDA2Q8TDQ7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GNPDA2Q8TDQ7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GNPDA2Q8TDQ7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GNPDA2Q8TDQ7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GNPDA2Q8TDQ7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GNPDA2Q8TDQ7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GNPDA2Q8TDQ7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GNPDA2Q8TDQ7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GNPDA2Q8TDQ7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.1 ms