Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

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Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF398Q8TD17 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF398Q8TD17 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF398Q8TD17 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF398Q8TD17 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF398Q8TD17 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF398Q8TD17 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF398Q8TD17 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF398Q8TD17 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF398Q8TD17 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF398Q8TD17 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF398Q8TD17 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF398Q8TD17 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF398Q8TD17 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF398Q8TD17 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
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