Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBR4

STAG3L4, Putative STAG3-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3L4Q8TBR4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
STAG3L4Q8TBR4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
STAG3L4Q8TBR4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STAG3L4Q8TBR4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STAG3L4Q8TBR4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STAG3L4Q8TBR4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
STAG3L4Q8TBR4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STAG3L4Q8TBR4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STAG3L4Q8TBR4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
STAG3L4Q8TBR4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
STAG3L4Q8TBR4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STAG3L4Q8TBR4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms