Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAU0

NKX2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-3Q8TAU0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NKX2-3Q8TAU0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NKX2-3Q8TAU0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NKX2-3Q8TAU0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NKX2-3Q8TAU0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NKX2-3Q8TAU0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NKX2-3Q8TAU0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NKX2-3Q8TAU0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NKX2-3Q8TAU0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NKX2-3Q8TAU0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NKX2-3Q8TAU0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NKX2-3Q8TAU0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NKX2-3Q8TAU0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NKX2-3Q8TAU0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NKX2-3Q8TAU0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NKX2-3Q8TAU0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NKX2-3Q8TAU0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NKX2-3Q8TAU0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NKX2-3Q8TAU0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NKX2-3Q8TAU0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NKX2-3Q8TAU0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NKX2-3Q8TAU0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NKX2-3Q8TAU0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NKX2-3Q8TAU0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NKX2-3Q8TAU0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NKX2-3Q8TAU0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NKX2-3Q8TAU0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NKX2-3Q8TAU0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NKX2-3Q8TAU0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NKX2-3Q8TAU0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NKX2-3Q8TAU0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NKX2-3Q8TAU0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NKX2-3Q8TAU0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NKX2-3Q8TAU0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NKX2-3Q8TAU0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NKX2-3Q8TAU0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NKX2-3Q8TAU0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NKX2-3Q8TAU0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NKX2-3Q8TAU0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NKX2-3Q8TAU0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NKX2-3Q8TAU0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NKX2-3Q8TAU0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NKX2-3Q8TAU0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NKX2-3Q8TAU0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NKX2-3Q8TAU0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NKX2-3Q8TAU0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NKX2-3Q8TAU0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NKX2-3Q8TAU0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NKX2-3Q8TAU0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NKX2-3Q8TAU0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NKX2-3Q8TAU0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NKX2-3Q8TAU0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NKX2-3Q8TAU0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NKX2-3Q8TAU0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NKX2-3Q8TAU0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NKX2-3Q8TAU0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NKX2-3Q8TAU0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NKX2-3Q8TAU0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NKX2-3Q8TAU0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NKX2-3Q8TAU0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NKX2-3Q8TAU0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NKX2-3Q8TAU0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NKX2-3Q8TAU0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NKX2-3Q8TAU0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NKX2-3Q8TAU0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NKX2-3Q8TAU0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NKX2-3Q8TAU0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NKX2-3Q8TAU0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NKX2-3Q8TAU0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NKX2-3Q8TAU0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NKX2-3Q8TAU0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NKX2-3Q8TAU0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NKX2-3Q8TAU0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NKX2-3Q8TAU0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NKX2-3Q8TAU0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NKX2-3Q8TAU0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NKX2-3Q8TAU0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NKX2-3Q8TAU0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NKX2-3Q8TAU0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NKX2-3Q8TAU0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NKX2-3Q8TAU0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NKX2-3Q8TAU0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NKX2-3Q8TAU0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NKX2-3Q8TAU0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NKX2-3Q8TAU0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NKX2-3Q8TAU0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NKX2-3Q8TAU0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NKX2-3Q8TAU0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NKX2-3Q8TAU0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NKX2-3Q8TAU0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NKX2-3Q8TAU0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NKX2-3Q8TAU0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NKX2-3Q8TAU0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NKX2-3Q8TAU0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NKX2-3Q8TAU0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NKX2-3Q8TAU0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NKX2-3Q8TAU0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NKX2-3Q8TAU0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NKX2-3Q8TAU0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NKX2-3Q8TAU0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms