Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI29

FBXO27, F-box only protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO27Q8NI29 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FBXO27Q8NI29 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO27Q8NI29 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms