Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS4

CLHC1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLHC1Q8NHS4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLHC1Q8NHS4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLHC1Q8NHS4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms