Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC54

KCT2, Keratinocyte-associated transmembrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCT2Q8NC54 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KCT2Q8NC54 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KCT2Q8NC54 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCT2Q8NC54 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCT2Q8NC54 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCT2Q8NC54 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCT2Q8NC54 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCT2Q8NC54 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCT2Q8NC54 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCT2Q8NC54 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCT2Q8NC54 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms