Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATAD1Q8NBU5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATAD1Q8NBU5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATAD1Q8NBU5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATAD1Q8NBU5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATAD1Q8NBU5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATAD1Q8NBU5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATAD1Q8NBU5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATAD1Q8NBU5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATAD1Q8NBU5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATAD1Q8NBU5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATAD1Q8NBU5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATAD1Q8NBU5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATAD1Q8NBU5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATAD1Q8NBU5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATAD1Q8NBU5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATAD1Q8NBU5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATAD1Q8NBU5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATAD1Q8NBU5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATAD1Q8NBU5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATAD1Q8NBU5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATAD1Q8NBU5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATAD1Q8NBU5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATAD1Q8NBU5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATAD1Q8NBU5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATAD1Q8NBU5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATAD1Q8NBU5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATAD1Q8NBU5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATAD1Q8NBU5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATAD1Q8NBU5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATAD1Q8NBU5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATAD1Q8NBU5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATAD1Q8NBU5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATAD1Q8NBU5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATAD1Q8NBU5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATAD1Q8NBU5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATAD1Q8NBU5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATAD1Q8NBU5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATAD1Q8NBU5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATAD1Q8NBU5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATAD1Q8NBU5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATAD1Q8NBU5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATAD1Q8NBU5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATAD1Q8NBU5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATAD1Q8NBU5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATAD1Q8NBU5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATAD1Q8NBU5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATAD1Q8NBU5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATAD1Q8NBU5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATAD1Q8NBU5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATAD1Q8NBU5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATAD1Q8NBU5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATAD1Q8NBU5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATAD1Q8NBU5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATAD1Q8NBU5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATAD1Q8NBU5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATAD1Q8NBU5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATAD1Q8NBU5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATAD1Q8NBU5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATAD1Q8NBU5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATAD1Q8NBU5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATAD1Q8NBU5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATAD1Q8NBU5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATAD1Q8NBU5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATAD1Q8NBU5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATAD1Q8NBU5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ATAD1Q8NBU5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATAD1Q8NBU5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATAD1Q8NBU5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ATAD1Q8NBU5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATAD1Q8NBU5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATAD1Q8NBU5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATAD1Q8NBU5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATAD1Q8NBU5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATAD1Q8NBU5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATAD1Q8NBU5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATAD1Q8NBU5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATAD1Q8NBU5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATAD1Q8NBU5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATAD1Q8NBU5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATAD1Q8NBU5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATAD1Q8NBU5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATAD1Q8NBU5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATAD1Q8NBU5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATAD1Q8NBU5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATAD1Q8NBU5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATAD1Q8NBU5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATAD1Q8NBU5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATAD1Q8NBU5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms