Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBP5

MFSD9, Major facilitator superfamily domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD9Q8NBP5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MFSD9Q8NBP5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD9Q8NBP5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD9Q8NBP5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD9Q8NBP5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD9Q8NBP5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MFSD9Q8NBP5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MFSD9Q8NBP5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MFSD9Q8NBP5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MFSD9Q8NBP5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD9Q8NBP5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD9Q8NBP5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD9Q8NBP5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD9Q8NBP5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD9Q8NBP5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD9Q8NBP5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD9Q8NBP5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MFSD9Q8NBP5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD9Q8NBP5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD9Q8NBP5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD9Q8NBP5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD9Q8NBP5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD9Q8NBP5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD9Q8NBP5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MFSD9Q8NBP5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD9Q8NBP5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD9Q8NBP5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD9Q8NBP5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD9Q8NBP5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD9Q8NBP5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MFSD9Q8NBP5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD9Q8NBP5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD9Q8NBP5 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD9Q8NBP5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD9Q8NBP5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD9Q8NBP5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD9Q8NBP5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD9Q8NBP5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD9Q8NBP5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD9Q8NBP5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD9Q8NBP5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MFSD9Q8NBP5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MFSD9Q8NBP5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MFSD9Q8NBP5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MFSD9Q8NBP5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MFSD9Q8NBP5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MFSD9Q8NBP5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MFSD9Q8NBP5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MFSD9Q8NBP5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD9Q8NBP5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD9Q8NBP5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD9Q8NBP5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD9Q8NBP5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD9Q8NBP5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD9Q8NBP5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD9Q8NBP5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD9Q8NBP5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MFSD9Q8NBP5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD9Q8NBP5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD9Q8NBP5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD9Q8NBP5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD9Q8NBP5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD9Q8NBP5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MFSD9Q8NBP5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD9Q8NBP5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD9Q8NBP5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD9Q8NBP5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD9Q8NBP5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD9Q8NBP5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MFSD9Q8NBP5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD9Q8NBP5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD9Q8NBP5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD9Q8NBP5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD9Q8NBP5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MFSD9Q8NBP5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD9Q8NBP5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD9Q8NBP5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD9Q8NBP5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD9Q8NBP5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD9Q8NBP5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD9Q8NBP5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD9Q8NBP5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MFSD9Q8NBP5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms