Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TTC29Q8NA56 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTC29Q8NA56 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TTC29Q8NA56 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms