Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8Q9

NIPA2, Magnesium transporter NIPA2, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPA2Q8N8Q9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIPA2Q8N8Q9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIPA2Q8N8Q9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIPA2Q8N8Q9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIPA2Q8N8Q9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIPA2Q8N8Q9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NIPA2Q8N8Q9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIPA2Q8N8Q9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIPA2Q8N8Q9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIPA2Q8N8Q9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NIPA2Q8N8Q9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NIPA2Q8N8Q9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NIPA2Q8N8Q9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NIPA2Q8N8Q9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NIPA2Q8N8Q9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NIPA2Q8N8Q9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NIPA2Q8N8Q9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NIPA2Q8N8Q9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NIPA2Q8N8Q9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NIPA2Q8N8Q9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NIPA2Q8N8Q9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NIPA2Q8N8Q9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NIPA2Q8N8Q9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NIPA2Q8N8Q9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NIPA2Q8N8Q9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NIPA2Q8N8Q9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NIPA2Q8N8Q9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NIPA2Q8N8Q9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NIPA2Q8N8Q9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIPA2Q8N8Q9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIPA2Q8N8Q9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIPA2Q8N8Q9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIPA2Q8N8Q9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIPA2Q8N8Q9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIPA2Q8N8Q9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIPA2Q8N8Q9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIPA2Q8N8Q9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NIPA2Q8N8Q9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NIPA2Q8N8Q9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NIPA2Q8N8Q9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NIPA2Q8N8Q9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NIPA2Q8N8Q9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NIPA2Q8N8Q9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NIPA2Q8N8Q9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NIPA2Q8N8Q9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NIPA2Q8N8Q9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NIPA2Q8N8Q9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NIPA2Q8N8Q9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NIPA2Q8N8Q9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NIPA2Q8N8Q9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NIPA2Q8N8Q9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NIPA2Q8N8Q9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms