Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RNF148Q8N7C7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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