Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMCO5AQ8N6Q1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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TMCO5AQ8N6Q1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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TMCO5AQ8N6Q1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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TMCO5AQ8N6Q1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCO5AQ8N6Q1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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TMCO5AQ8N6Q1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO5AQ8N6Q1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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TMCO5AQ8N6Q1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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TMCO5AQ8N6Q1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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TMCO5AQ8N6Q1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCO5AQ8N6Q1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCO5AQ8N6Q1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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TMCO5AQ8N6Q1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMCO5AQ8N6Q1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCO5AQ8N6Q1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCO5AQ8N6Q1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCO5AQ8N6Q1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCO5AQ8N6Q1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCO5AQ8N6Q1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCO5AQ8N6Q1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCO5AQ8N6Q1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCO5AQ8N6Q1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMCO5AQ8N6Q1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO5AQ8N6Q1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO5AQ8N6Q1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO5AQ8N6Q1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO5AQ8N6Q1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMCO5AQ8N6Q1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO5AQ8N6Q1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMCO5AQ8N6Q1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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