Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L1

KRTCAP2, Keratinocyte-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTCAP2Q8N6L1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRTCAP2Q8N6L1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRTCAP2Q8N6L1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms