Protein–RNA interactions for Protein: Q8N511

TMEM199, Transmembrane protein 199, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM199Q8N511 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM199Q8N511 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM199Q8N511 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM199Q8N511 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM199Q8N511 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM199Q8N511 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM199Q8N511 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM199Q8N511 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM199Q8N511 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM199Q8N511 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM199Q8N511 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM199Q8N511 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM199Q8N511 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM199Q8N511 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM199Q8N511 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM199Q8N511 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM199Q8N511 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM199Q8N511 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM199Q8N511 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM199Q8N511 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM199Q8N511 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM199Q8N511 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM199Q8N511 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TMEM199Q8N511 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM199Q8N511 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM199Q8N511 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM199Q8N511 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM199Q8N511 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM199Q8N511 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMEM199Q8N511 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM199Q8N511 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM199Q8N511 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM199Q8N511 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM199Q8N511 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM199Q8N511 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM199Q8N511 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM199Q8N511 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM199Q8N511 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM199Q8N511 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM199Q8N511 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM199Q8N511 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM199Q8N511 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM199Q8N511 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM199Q8N511 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM199Q8N511 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM199Q8N511 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM199Q8N511 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM199Q8N511 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM199Q8N511 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM199Q8N511 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM199Q8N511 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM199Q8N511 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM199Q8N511 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM199Q8N511 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM199Q8N511 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM199Q8N511 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM199Q8N511 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMEM199Q8N511 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms