Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CRACR2BQ8N4Y2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRACR2BQ8N4Y2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRACR2BQ8N4Y2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CRACR2BQ8N4Y2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CRACR2BQ8N4Y2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CRACR2BQ8N4Y2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CRACR2BQ8N4Y2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CRACR2BQ8N4Y2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CRACR2BQ8N4Y2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CRACR2BQ8N4Y2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CRACR2BQ8N4Y2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CRACR2BQ8N4Y2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CRACR2BQ8N4Y2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CRACR2BQ8N4Y2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CRACR2BQ8N4Y2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CRACR2BQ8N4Y2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CRACR2BQ8N4Y2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CRACR2BQ8N4Y2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CRACR2BQ8N4Y2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CRACR2BQ8N4Y2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRACR2BQ8N4Y2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRACR2BQ8N4Y2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRACR2BQ8N4Y2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRACR2BQ8N4Y2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRACR2BQ8N4Y2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRACR2BQ8N4Y2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRACR2BQ8N4Y2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRACR2BQ8N4Y2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRACR2BQ8N4Y2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRACR2BQ8N4Y2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRACR2BQ8N4Y2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CRACR2BQ8N4Y2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CRACR2BQ8N4Y2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CRACR2BQ8N4Y2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CRACR2BQ8N4Y2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRACR2BQ8N4Y2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRACR2BQ8N4Y2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRACR2BQ8N4Y2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CRACR2BQ8N4Y2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CRACR2BQ8N4Y2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CRACR2BQ8N4Y2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CRACR2BQ8N4Y2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRACR2BQ8N4Y2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRACR2BQ8N4Y2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRACR2BQ8N4Y2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CRACR2BQ8N4Y2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CRACR2BQ8N4Y2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CRACR2BQ8N4Y2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CRACR2BQ8N4Y2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CRACR2BQ8N4Y2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CRACR2BQ8N4Y2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CRACR2BQ8N4Y2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CRACR2BQ8N4Y2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CRACR2BQ8N4Y2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CRACR2BQ8N4Y2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CRACR2BQ8N4Y2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CRACR2BQ8N4Y2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CRACR2BQ8N4Y2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CRACR2BQ8N4Y2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CRACR2BQ8N4Y2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CRACR2BQ8N4Y2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CRACR2BQ8N4Y2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CRACR2BQ8N4Y2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CRACR2BQ8N4Y2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CRACR2BQ8N4Y2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms