Protein–RNA interactions for Protein: Q8N135

LGI4, Leucine-rich repeat LGI family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI4Q8N135 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGI4Q8N135 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LGI4Q8N135 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 198.6 ms