Protein–RNA interactions for Protein: Q8N112

LSMEM2, Leucine-rich single-pass membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSMEM2Q8N112 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSMEM2Q8N112 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSMEM2Q8N112 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSMEM2Q8N112 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LSMEM2Q8N112 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSMEM2Q8N112 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSMEM2Q8N112 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSMEM2Q8N112 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSMEM2Q8N112 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSMEM2Q8N112 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSMEM2Q8N112 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSMEM2Q8N112 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSMEM2Q8N112 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSMEM2Q8N112 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LSMEM2Q8N112 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSMEM2Q8N112 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSMEM2Q8N112 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSMEM2Q8N112 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LSMEM2Q8N112 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LSMEM2Q8N112 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LSMEM2Q8N112 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LSMEM2Q8N112 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LSMEM2Q8N112 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LSMEM2Q8N112 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSMEM2Q8N112 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSMEM2Q8N112 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSMEM2Q8N112 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSMEM2Q8N112 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSMEM2Q8N112 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSMEM2Q8N112 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSMEM2Q8N112 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSMEM2Q8N112 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LSMEM2Q8N112 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSMEM2Q8N112 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LSMEM2Q8N112 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSMEM2Q8N112 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LSMEM2Q8N112 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LSMEM2Q8N112 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSMEM2Q8N112 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSMEM2Q8N112 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSMEM2Q8N112 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LSMEM2Q8N112 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms