Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYE1

CCDC13, Coiled-coil domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC13Q8IYE1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC13Q8IYE1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC13Q8IYE1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC13Q8IYE1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms