Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWV2

CNTN4, Contactin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN4Q8IWV2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN4Q8IWV2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN4Q8IWV2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTN4Q8IWV2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTN4Q8IWV2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN4Q8IWV2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN4Q8IWV2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN4Q8IWV2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN4Q8IWV2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN4Q8IWV2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN4Q8IWV2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN4Q8IWV2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN4Q8IWV2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN4Q8IWV2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN4Q8IWV2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN4Q8IWV2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN4Q8IWV2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN4Q8IWV2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN4Q8IWV2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN4Q8IWV2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN4Q8IWV2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN4Q8IWV2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN4Q8IWV2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN4Q8IWV2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN4Q8IWV2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN4Q8IWV2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN4Q8IWV2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN4Q8IWV2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN4Q8IWV2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN4Q8IWV2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN4Q8IWV2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN4Q8IWV2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN4Q8IWV2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN4Q8IWV2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN4Q8IWV2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN4Q8IWV2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN4Q8IWV2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN4Q8IWV2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN4Q8IWV2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN4Q8IWV2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN4Q8IWV2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN4Q8IWV2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CNTN4Q8IWV2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms