Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC117Q8IWD4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC117Q8IWD4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC117Q8IWD4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC117Q8IWD4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC117Q8IWD4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC117Q8IWD4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC117Q8IWD4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC117Q8IWD4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC117Q8IWD4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC117Q8IWD4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC117Q8IWD4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC117Q8IWD4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC117Q8IWD4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC117Q8IWD4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC117Q8IWD4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC117Q8IWD4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC117Q8IWD4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC117Q8IWD4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC117Q8IWD4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC117Q8IWD4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC117Q8IWD4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC117Q8IWD4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC117Q8IWD4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC117Q8IWD4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC117Q8IWD4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC117Q8IWD4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC117Q8IWD4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC117Q8IWD4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC117Q8IWD4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC117Q8IWD4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC117Q8IWD4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC117Q8IWD4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC117Q8IWD4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms