Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERC6Q8IVU3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERC6Q8IVU3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HERC6Q8IVU3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERC6Q8IVU3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERC6Q8IVU3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERC6Q8IVU3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERC6Q8IVU3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERC6Q8IVU3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERC6Q8IVU3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERC6Q8IVU3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HERC6Q8IVU3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HERC6Q8IVU3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HERC6Q8IVU3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HERC6Q8IVU3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HERC6Q8IVU3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HERC6Q8IVU3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HERC6Q8IVU3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HERC6Q8IVU3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
HERC6Q8IVU3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HERC6Q8IVU3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERC6Q8IVU3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERC6Q8IVU3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERC6Q8IVU3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERC6Q8IVU3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERC6Q8IVU3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HERC6Q8IVU3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERC6Q8IVU3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERC6Q8IVU3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERC6Q8IVU3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERC6Q8IVU3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERC6Q8IVU3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERC6Q8IVU3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HERC6Q8IVU3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HERC6Q8IVU3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERC6Q8IVU3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERC6Q8IVU3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERC6Q8IVU3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERC6Q8IVU3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HERC6Q8IVU3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HERC6Q8IVU3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HERC6Q8IVU3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERC6Q8IVU3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERC6Q8IVU3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERC6Q8IVU3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERC6Q8IVU3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERC6Q8IVU3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERC6Q8IVU3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HERC6Q8IVU3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERC6Q8IVU3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERC6Q8IVU3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HERC6Q8IVU3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERC6Q8IVU3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERC6Q8IVU3 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERC6Q8IVU3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
HERC6Q8IVU3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERC6Q8IVU3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HERC6Q8IVU3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC6Q8IVU3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC6Q8IVU3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC6Q8IVU3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC6Q8IVU3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC6Q8IVU3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HERC6Q8IVU3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERC6Q8IVU3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERC6Q8IVU3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERC6Q8IVU3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HERC6Q8IVU3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERC6Q8IVU3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERC6Q8IVU3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERC6Q8IVU3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERC6Q8IVU3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HERC6Q8IVU3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERC6Q8IVU3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERC6Q8IVU3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERC6Q8IVU3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERC6Q8IVU3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERC6Q8IVU3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HERC6Q8IVU3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERC6Q8IVU3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HERC6Q8IVU3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERC6Q8IVU3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERC6Q8IVU3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERC6Q8IVU3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HERC6Q8IVU3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERC6Q8IVU3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERC6Q8IVU3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERC6Q8IVU3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HERC6Q8IVU3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERC6Q8IVU3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERC6Q8IVU3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HERC6Q8IVU3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERC6Q8IVU3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HERC6Q8IVU3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERC6Q8IVU3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERC6Q8IVU3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HERC6Q8IVU3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HERC6Q8IVU3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HERC6Q8IVU3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HERC6Q8IVU3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms