Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVF7

FMNL3, Formin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMNL3Q8IVF7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FMNL3Q8IVF7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FMNL3Q8IVF7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FMNL3Q8IVF7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FMNL3Q8IVF7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FMNL3Q8IVF7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FMNL3Q8IVF7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FMNL3Q8IVF7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FMNL3Q8IVF7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FMNL3Q8IVF7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FMNL3Q8IVF7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FMNL3Q8IVF7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FMNL3Q8IVF7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FMNL3Q8IVF7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FMNL3Q8IVF7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FMNL3Q8IVF7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FMNL3Q8IVF7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FMNL3Q8IVF7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FMNL3Q8IVF7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FMNL3Q8IVF7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FMNL3Q8IVF7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FMNL3Q8IVF7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FMNL3Q8IVF7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FMNL3Q8IVF7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FMNL3Q8IVF7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FMNL3Q8IVF7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FMNL3Q8IVF7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FMNL3Q8IVF7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FMNL3Q8IVF7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FMNL3Q8IVF7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FMNL3Q8IVF7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FMNL3Q8IVF7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FMNL3Q8IVF7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FMNL3Q8IVF7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FMNL3Q8IVF7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FMNL3Q8IVF7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FMNL3Q8IVF7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FMNL3Q8IVF7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FMNL3Q8IVF7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FMNL3Q8IVF7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FMNL3Q8IVF7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
FMNL3Q8IVF7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FMNL3Q8IVF7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FMNL3Q8IVF7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FMNL3Q8IVF7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FMNL3Q8IVF7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FMNL3Q8IVF7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FMNL3Q8IVF7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FMNL3Q8IVF7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FMNL3Q8IVF7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FMNL3Q8IVF7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FMNL3Q8IVF7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FMNL3Q8IVF7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FMNL3Q8IVF7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FMNL3Q8IVF7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms