Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC71Q8IV32 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC71Q8IV32 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms