Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU89

CERS3, Ceramide synthase 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS3Q8IU89 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CERS3Q8IU89 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CERS3Q8IU89 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CERS3Q8IU89 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CERS3Q8IU89 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CERS3Q8IU89 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CERS3Q8IU89 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CERS3Q8IU89 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CERS3Q8IU89 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CERS3Q8IU89 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CERS3Q8IU89 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CERS3Q8IU89 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CERS3Q8IU89 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CERS3Q8IU89 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CERS3Q8IU89 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CERS3Q8IU89 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CERS3Q8IU89 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CERS3Q8IU89 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CERS3Q8IU89 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CERS3Q8IU89 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CERS3Q8IU89 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CERS3Q8IU89 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CERS3Q8IU89 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CERS3Q8IU89 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CERS3Q8IU89 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CERS3Q8IU89 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CERS3Q8IU89 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CERS3Q8IU89 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CERS3Q8IU89 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CERS3Q8IU89 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CERS3Q8IU89 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CERS3Q8IU89 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CERS3Q8IU89 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CERS3Q8IU89 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CERS3Q8IU89 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CERS3Q8IU89 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CERS3Q8IU89 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CERS3Q8IU89 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CERS3Q8IU89 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CERS3Q8IU89 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CERS3Q8IU89 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CERS3Q8IU89 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CERS3Q8IU89 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CERS3Q8IU89 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CERS3Q8IU89 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CERS3Q8IU89 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CERS3Q8IU89 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CERS3Q8IU89 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CERS3Q8IU89 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CERS3Q8IU89 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CERS3Q8IU89 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CERS3Q8IU89 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CERS3Q8IU89 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CERS3Q8IU89 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CERS3Q8IU89 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CERS3Q8IU89 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CERS3Q8IU89 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CERS3Q8IU89 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CERS3Q8IU89 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1112.2 ms