Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y13

DZIP3, E3 ubiquitin-protein ligase DZIP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DZIP3Q86Y13 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DZIP3Q86Y13 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DZIP3Q86Y13 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DZIP3Q86Y13 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DZIP3Q86Y13 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DZIP3Q86Y13 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DZIP3Q86Y13 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
DZIP3Q86Y13 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
DZIP3Q86Y13 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DZIP3Q86Y13 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DZIP3Q86Y13 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
DZIP3Q86Y13 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
DZIP3Q86Y13 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
DZIP3Q86Y13 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
DZIP3Q86Y13 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
DZIP3Q86Y13 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
DZIP3Q86Y13 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DZIP3Q86Y13 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DZIP3Q86Y13 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DZIP3Q86Y13 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DZIP3Q86Y13 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DZIP3Q86Y13 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DZIP3Q86Y13 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
DZIP3Q86Y13 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DZIP3Q86Y13 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DZIP3Q86Y13 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DZIP3Q86Y13 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
DZIP3Q86Y13 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
DZIP3Q86Y13 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
DZIP3Q86Y13 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
DZIP3Q86Y13 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DZIP3Q86Y13 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DZIP3Q86Y13 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DZIP3Q86Y13 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DZIP3Q86Y13 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
DZIP3Q86Y13 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DZIP3Q86Y13 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DZIP3Q86Y13 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DZIP3Q86Y13 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
DZIP3Q86Y13 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DZIP3Q86Y13 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DZIP3Q86Y13 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DZIP3Q86Y13 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
DZIP3Q86Y13 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
DZIP3Q86Y13 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DZIP3Q86Y13 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
DZIP3Q86Y13 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DZIP3Q86Y13 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DZIP3Q86Y13 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
DZIP3Q86Y13 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
DZIP3Q86Y13 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
DZIP3Q86Y13 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
DZIP3Q86Y13 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
DZIP3Q86Y13 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
DZIP3Q86Y13 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
DZIP3Q86Y13 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
DZIP3Q86Y13 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
DZIP3Q86Y13 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DZIP3Q86Y13 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DZIP3Q86Y13 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DZIP3Q86Y13 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
DZIP3Q86Y13 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DZIP3Q86Y13 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DZIP3Q86Y13 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
DZIP3Q86Y13 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
DZIP3Q86Y13 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
DZIP3Q86Y13 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
DZIP3Q86Y13 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
DZIP3Q86Y13 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
DZIP3Q86Y13 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
DZIP3Q86Y13 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
DZIP3Q86Y13 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
DZIP3Q86Y13 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
DZIP3Q86Y13 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DZIP3Q86Y13 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DZIP3Q86Y13 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DZIP3Q86Y13 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DZIP3Q86Y13 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DZIP3Q86Y13 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DZIP3Q86Y13 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
DZIP3Q86Y13 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
DZIP3Q86Y13 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
DZIP3Q86Y13 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
DZIP3Q86Y13 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
DZIP3Q86Y13 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
DZIP3Q86Y13 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
DZIP3Q86Y13 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
DZIP3Q86Y13 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
DZIP3Q86Y13 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
DZIP3Q86Y13 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DZIP3Q86Y13 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
DZIP3Q86Y13 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DZIP3Q86Y13 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DZIP3Q86Y13 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DZIP3Q86Y13 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
DZIP3Q86Y13 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DZIP3Q86Y13 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DZIP3Q86Y13 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DZIP3Q86Y13 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DZIP3Q86Y13 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms