Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX20Q7Z614 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX20Q7Z614 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNX20Q7Z614 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX20Q7Z614 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX20Q7Z614 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX20Q7Z614 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX20Q7Z614 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX20Q7Z614 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX20Q7Z614 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX20Q7Z614 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX20Q7Z614 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX20Q7Z614 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX20Q7Z614 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX20Q7Z614 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX20Q7Z614 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX20Q7Z614 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX20Q7Z614 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX20Q7Z614 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX20Q7Z614 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX20Q7Z614 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX20Q7Z614 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX20Q7Z614 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX20Q7Z614 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX20Q7Z614 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX20Q7Z614 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX20Q7Z614 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX20Q7Z614 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX20Q7Z614 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX20Q7Z614 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX20Q7Z614 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX20Q7Z614 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX20Q7Z614 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX20Q7Z614 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX20Q7Z614 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX20Q7Z614 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX20Q7Z614 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX20Q7Z614 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms