Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC80Q76M96 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC80Q76M96 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC80Q76M96 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms