Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMUB2Q71RG4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMUB2Q71RG4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMUB2Q71RG4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMUB2Q71RG4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMUB2Q71RG4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TMUB2Q71RG4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TMUB2Q71RG4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TMUB2Q71RG4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TMUB2Q71RG4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMUB2Q71RG4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMUB2Q71RG4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMUB2Q71RG4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMUB2Q71RG4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMUB2Q71RG4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMUB2Q71RG4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TMUB2Q71RG4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMUB2Q71RG4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMUB2Q71RG4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.9 ms