Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SMIM5Q71RC9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SMIM5Q71RC9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SMIM5Q71RC9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SMIM5Q71RC9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SMIM5Q71RC9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
SMIM5Q71RC9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SMIM5Q71RC9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SMIM5Q71RC9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMIM5Q71RC9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMIM5Q71RC9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SMIM5Q71RC9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMIM5Q71RC9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMIM5Q71RC9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMIM5Q71RC9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SMIM5Q71RC9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SMIM5Q71RC9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMIM5Q71RC9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMIM5Q71RC9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SMIM5Q71RC9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMIM5Q71RC9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMIM5Q71RC9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMIM5Q71RC9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMIM5Q71RC9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMIM5Q71RC9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SMIM5Q71RC9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMIM5Q71RC9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMIM5Q71RC9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMIM5Q71RC9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
SMIM5Q71RC9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMIM5Q71RC9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMIM5Q71RC9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SMIM5Q71RC9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMIM5Q71RC9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMIM5Q71RC9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMIM5Q71RC9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMIM5Q71RC9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMIM5Q71RC9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SMIM5Q71RC9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SMIM5Q71RC9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SMIM5Q71RC9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
SMIM5Q71RC9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SMIM5Q71RC9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SMIM5Q71RC9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SMIM5Q71RC9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SMIM5Q71RC9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SMIM5Q71RC9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SMIM5Q71RC9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SMIM5Q71RC9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SMIM5Q71RC9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SMIM5Q71RC9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SMIM5Q71RC9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SMIM5Q71RC9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SMIM5Q71RC9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SMIM5Q71RC9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
SMIM5Q71RC9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SMIM5Q71RC9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SMIM5Q71RC9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SMIM5Q71RC9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SMIM5Q71RC9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SMIM5Q71RC9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SMIM5Q71RC9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SMIM5Q71RC9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SMIM5Q71RC9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SMIM5Q71RC9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
SMIM5Q71RC9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
SMIM5Q71RC9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SMIM5Q71RC9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SMIM5Q71RC9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SMIM5Q71RC9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SMIM5Q71RC9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SMIM5Q71RC9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SMIM5Q71RC9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SMIM5Q71RC9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
SMIM5Q71RC9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SMIM5Q71RC9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SMIM5Q71RC9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
SMIM5Q71RC9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
SMIM5Q71RC9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SMIM5Q71RC9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SMIM5Q71RC9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SMIM5Q71RC9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SMIM5Q71RC9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30■■■□□ 2.39
SMIM5Q71RC9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMIM5Q71RC9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMIM5Q71RC9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SMIM5Q71RC9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMIM5Q71RC9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMIM5Q71RC9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMIM5Q71RC9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMIM5Q71RC9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMIM5Q71RC9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMIM5Q71RC9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SMIM5Q71RC9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMIM5Q71RC9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SMIM5Q71RC9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMIM5Q71RC9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SMIM5Q71RC9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SMIM5Q71RC9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SMIM5Q71RC9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms