Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSY5

PPP1R3F, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3FQ6ZSY5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPP1R3FQ6ZSY5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PPP1R3FQ6ZSY5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PPP1R3FQ6ZSY5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPP1R3FQ6ZSY5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPP1R3FQ6ZSY5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPP1R3FQ6ZSY5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPP1R3FQ6ZSY5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPP1R3FQ6ZSY5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPP1R3FQ6ZSY5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPP1R3FQ6ZSY5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPP1R3FQ6ZSY5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPP1R3FQ6ZSY5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPP1R3FQ6ZSY5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPP1R3FQ6ZSY5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPP1R3FQ6ZSY5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PPP1R3FQ6ZSY5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PPP1R3FQ6ZSY5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PPP1R3FQ6ZSY5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPP1R3FQ6ZSY5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPP1R3FQ6ZSY5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPP1R3FQ6ZSY5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPP1R3FQ6ZSY5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PPP1R3FQ6ZSY5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPP1R3FQ6ZSY5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPP1R3FQ6ZSY5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPP1R3FQ6ZSY5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPP1R3FQ6ZSY5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPP1R3FQ6ZSY5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPP1R3FQ6ZSY5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPP1R3FQ6ZSY5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPP1R3FQ6ZSY5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPP1R3FQ6ZSY5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPP1R3FQ6ZSY5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPP1R3FQ6ZSY5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPP1R3FQ6ZSY5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPP1R3FQ6ZSY5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPP1R3FQ6ZSY5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPP1R3FQ6ZSY5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPP1R3FQ6ZSY5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PPP1R3FQ6ZSY5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PPP1R3FQ6ZSY5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPP1R3FQ6ZSY5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPP1R3FQ6ZSY5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PPP1R3FQ6ZSY5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP1R3FQ6ZSY5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP1R3FQ6ZSY5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP1R3FQ6ZSY5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP1R3FQ6ZSY5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP1R3FQ6ZSY5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP1R3FQ6ZSY5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPP1R3FQ6ZSY5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PPP1R3FQ6ZSY5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPP1R3FQ6ZSY5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PPP1R3FQ6ZSY5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PPP1R3FQ6ZSY5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PPP1R3FQ6ZSY5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPP1R3FQ6ZSY5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms