Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CCDC141Q6ZP82 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CCDC141Q6ZP82 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CCDC141Q6ZP82 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CCDC141Q6ZP82 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CCDC141Q6ZP82 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
CCDC141Q6ZP82 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC141Q6ZP82 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC141Q6ZP82 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC141Q6ZP82 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC141Q6ZP82 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC141Q6ZP82 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC141Q6ZP82 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC141Q6ZP82 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC141Q6ZP82 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC141Q6ZP82 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC141Q6ZP82 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC141Q6ZP82 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC141Q6ZP82 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC141Q6ZP82 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CCDC141Q6ZP82 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CCDC141Q6ZP82 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CCDC141Q6ZP82 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CCDC141Q6ZP82 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
CCDC141Q6ZP82 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CCDC141Q6ZP82 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CCDC141Q6ZP82 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CCDC141Q6ZP82 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CCDC141Q6ZP82 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CCDC141Q6ZP82 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CCDC141Q6ZP82 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CCDC141Q6ZP82 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CCDC141Q6ZP82 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CCDC141Q6ZP82 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CCDC141Q6ZP82 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CCDC141Q6ZP82 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
CCDC141Q6ZP82 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CCDC141Q6ZP82 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CCDC141Q6ZP82 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CCDC141Q6ZP82 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CCDC141Q6ZP82 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CCDC141Q6ZP82 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CCDC141Q6ZP82 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CCDC141Q6ZP82 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CCDC141Q6ZP82 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CCDC141Q6ZP82 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CCDC141Q6ZP82 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
CCDC141Q6ZP82 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CCDC141Q6ZP82 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CCDC141Q6ZP82 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CCDC141Q6ZP82 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CCDC141Q6ZP82 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CCDC141Q6ZP82 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CCDC141Q6ZP82 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CCDC141Q6ZP82 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CCDC141Q6ZP82 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
CCDC141Q6ZP82 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CCDC141Q6ZP82 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CCDC141Q6ZP82 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CCDC141Q6ZP82 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CCDC141Q6ZP82 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CCDC141Q6ZP82 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CCDC141Q6ZP82 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CCDC141Q6ZP82 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CCDC141Q6ZP82 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
CCDC141Q6ZP82 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CCDC141Q6ZP82 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CCDC141Q6ZP82 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CCDC141Q6ZP82 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CCDC141Q6ZP82 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CCDC141Q6ZP82 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CCDC141Q6ZP82 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CCDC141Q6ZP82 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CCDC141Q6ZP82 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CCDC141Q6ZP82 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCDC141Q6ZP82 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCDC141Q6ZP82 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
CCDC141Q6ZP82 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCDC141Q6ZP82 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCDC141Q6ZP82 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCDC141Q6ZP82 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CCDC141Q6ZP82 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CCDC141Q6ZP82 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC141Q6ZP82 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC141Q6ZP82 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC141Q6ZP82 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CCDC141Q6ZP82 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CCDC141Q6ZP82 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CCDC141Q6ZP82 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CCDC141Q6ZP82 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
CCDC141Q6ZP82 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CCDC141Q6ZP82 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CCDC141Q6ZP82 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
CCDC141Q6ZP82 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CCDC141Q6ZP82 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CCDC141Q6ZP82 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
CCDC141Q6ZP82 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCDC141Q6ZP82 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCDC141Q6ZP82 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCDC141Q6ZP82 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms