Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNA4

RNF111, E3 ubiquitin-protein ligase Arkadia, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF111Q6ZNA4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF111Q6ZNA4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF111Q6ZNA4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF111Q6ZNA4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms